Me ha entrado curiosidad, y después de buscar, he confeccionado todo esto; (quizá no responda exactamente tu pregunta pero... igual nadie la sabe con certeza... )

La química del pensamiento es el resultado de la acción de los neurotransmisores(1) en los procesos sinápticos(2).
(1) Sustancia química que transmite información de una neurona a otra atravesando el espacio que separa dos neuronas consecutivas.
(2) Unión intercelular especializada entre neuronas;
Tipos>
Sinapsis eléctrica ; Se establece entre células que están separadas entre sí por un espacio de unos a 2 nanómetrosm. La transmisión entre la primera neurona y la segunda no se produce por la secreción de un neurotransmisor sino por el paso de
iones de una célula a otra a través de uniones gap (cierta clase de conexiones que se observan a veces entre las células en tejidos animales)

Sinapsis química; Se establece entre células que están separadas entre sí por un espacio de unos 20-30 nanómetros . La transmisión entre la primera neurona y la segunda se produce por la secreción neurotransmisores (iniciadados por la llegada de un impulso nervioso), que excitan o inhiben la acción de la otra neurona.

Los neurotrotransmisores en los procesos sinápticos, trazan mapas celulares que permiten la memória, el aprendizaje, y todo tipo de comportamiento humano; y actúan energizando o inhibiendo la función neuronal.

Neurona: Tipo de célula especializada en la recepción de estímulos (factor externo o interno capaz de provocar una reacción en una célula u organismo.) y conducción del impulso nervioso (onda de descarga eléctrica que viaja a lo largo de la membrana celular.) Los nervios sensitivos se encargan de conducir las excitaciones del exterior hacia los centros nerviosos.

La función neurológica radica en las neuronas como entidades discretas, cuya interacción, mediada por sinapsis, conduce a la aparición de respuestas complejas.

Nuestra química cerebral determina nuestro comportamiento;
Somos nobles, agradecidos, y generosos, cuando tenemos altos niveles de endovalium, endorfina, y ácido gamamino-butírico.
Somos envidiosos, odiosos, y agresivos, cuando tenemos altos niveles de adrenalina, y mínimos niveles de oxitocina y endorfina.



La química de la lectura;
Los ojos no ven; es el cerebro el que ve a través de ellos.
Los ojos no leen, solo fotografían el texto que es revelado en el área visual primaria, y enviada al área visual secundaria para su interpretación cerebral; donde se valorará o censurará por contraste, dependiendo de conocimientos previos y disposición neuronal del sujeto.

El destino final de la imagen o del texto fotografiado por los ojos es el hipocampo; que decide si se envía a la base de datos o se desecha… y todo ello en una fracción de segundo.
La comprensión significativa de todo el proceso se da en las distintas áreas de la neocorteza.

Neocorteza: Areas más evolucionadas del córtex. Juega un papel importante en funciones como la percepción sensorial, la generación de órdenes motrices, razonamiento espacial, el pensamiento consciente y, en los humanos, el lenguaje.

Esta es la capa que nos proporciona todos nuestros recuerdos, conocimientos, habilidades y experiencia acumulada gracias a sus 30.000 millones de neuronas. Responde típicamente a un estímulo sensorial que representa una cierta parte del cuerpo o la región del sonido o de la visión.
Conocer la química del pensamiento y permitir que la amígdala cerebral genere emociones en torno a los procesos de aprendizaje y memoria, nos facilita la lectura interpretativa y el logor de saberes y nociones personales en el rango de la comprensión significaticva.

La capacidad humana de contemplar ideas está a sociada a la capacidad de razonamiento; facultad que permite al ser identificar, comparar y clasificar conceptos relacionando unos con otros según sus semejanzas y diferencias; cuestionando su significado y el sentido de su uso, hallando coherencias o contradicciones entre ellos y así inducir o deducir otros conceptos nuevos y distintos de los que ya conoce.

El pensamiento es la actividad y creación de la mente; dícese de todo aquello que es traído a existencia mediante la actividad del intelecto (Capacidad de formar ideas o representaciones de la realidad en la mente relacionándolas entre sí)

Una red neuronal o un circuito neuronal es un conjunto de conexiones sinápticas ordenadas que se produce como resultado de la unión de las neuronas a otras en sus regiones correspondientes tras la migración neuronal.

Una vez que los axones alcanzan sus dianas, deben seleccionar las células apropiadas para formar conexiones sinápticas. Muchas proyecciones axonales en el cerebro establecen una distribución ordenada de conexiones en su campo diana. Esto se llama mapa topográfico. Esos mapas están dispuestos de forma que el orden espacial en las células de origen está reflejado en el orden espacial de las terminaciones de los axones, así, las células vecinas proyectan a partes vecinas para formar un mapa continuo.

La memoria(*) semántica se ubica en el hipocampo.

(*)La memoria es una función del cerebro y, a la vez, un fenómeno de la mente que permite al organismo codificar, almacenar y recuperar información. Surge como resultado de las conexiones sinápticas repetitivas entre las neuronas, lo que crea redes neuronales (la llamada potenciación a largo plazo). No existe un único lugar físico para la memoria en nuestro cerebro.

La memoria está diseminada por distintas localizaciones especializadas. Mientras en algunas regiones del córtex temporal están almacenados los recuerdos de nuestra más tierna infancia, el significado de las palabras se guarda en la región central del hemisferio derecho y los datos de aprendizaje en el córtex parieto-temporal.

Los lóbulos frontales se dedican a organizar la percepción y el pensamiento. Muchos de nuestros automatismos están almacenados en el cerebelo.

La memoria kinestésica o implícita, la que nos permite aprender y seguir aprendiendo, se ubica en los lóbulos occipitales y el cerebelo.
La memória semática guarda palabras, lenguajes y símbolos que nos permiten comunicarnos y auspician el crecimiento personal

Etc (Hay diversos tipos de memoria y de inteligencia)

La información nueva que percibimos rebota en el área del pensamiento durante unas milésimas de segundo, hasta encontrar un conocimiento previo que la sustente para seguir el proceso… Si no hay conocimiento previo que la sustente, entonces el proceso será más complicado.
No se conoce demasiado sobre las bases neurofisológicas del aprendizaje, sin embargo, se tienen algunos indicios importantes de que éste está relacionado con la modificación de las conexiones sinápticas. En concreto, comúnmente se admite como hipótesis que:

• El aprendizaje es el resultado del fortalecimiento o abandono de las conexiones sinápticas entre neuronas.

• El aprendizaje es local, es decir, la modificación de una conexión sináptica depende sólo de las actividad (potencial eléctrico) de las neurona presináptica y de la neurona postsináptica.

• La modificación de las sinapsis es un proceso relativamente lento comparado con los tiempos típicos de los cambios en los potenciales eléctricos que sirven de señal entre las neuronas.

• Si la neurona presináptica o la neurona postsináptica (o ambas) están inactivas, entonces la única modificación sináptica existente consiste en el deterioro o decaimiento potencial de la sinapsis, que es responsable del olvido.

Para aprender, se construyen nuevas representaciones mentales significativas y funcionales (conocimientos), que luego se pueden aplicar en situaciones diferentes a los contextos donde se aprendieron. Aprender no solamente consiste en memorizar información, es necesario también otras operaciones cognitivas que implican: conocer, comprender, aplicar, analizar, sintetizar y valorar.

Químicamente, una decisión es el producto final del proceso mental-cognitivo específico de un individuo.

Termino con una cita que ya pude en otro hilo;
(...) Según Stephen Downes, lo que llamamos conocimiento es el reconocimiento de un patrón de relaciones en un conjunto de eventos neuronales. (...)nuestros pensamientos pudieran no tener sentido, pudiera no existir el yo humano, el motor que nos hace creativos día con día, el ser cada uno diferente, vivir emociones y fracasos, esperanzas e ilusiones, ser buenos o malos, tener significado en nuestras vidas. Si nuestro pensamiento y aprendizaje responde a un reconocimiento automático de patrones en la red neuronal, nuestro pensamiento tiene entonces una razón materialista, es producto físico, reside en algo biológico, en nuestra red neuronal, no existe propiamente el yo humano, somos robots, robots biológicos, autómatas biológicos (...)
Si Downes está en lo cierto, no desesperarse, todo tiene su explicación física y algún día podremos contestar del todo lo que pregunta de lgv...

PD: Espero mi reputación