Las ballenas, como cualquier animal o planta, almacenan dioxido de carbono, pero debido a su tamaño la cantidad es significativa; cuando las matan y sacan del oceano, lo liberan a la atmosfera. Por lo tanto, al dejar crecer sus poblaciones, se puede capturar gases con efecto invernadero en la misma medida que los esquemas de reforestacion.
Es probable que la caza comercial de ballenas haya liberado alrededor de cien millones de toneladas de dioxido de carbono a la atmosfera en un siglo mas o menos. Se podria comparar a las ballenas con las secuoyas, como depositos de carbono. Las ballenas azules contienen alrededor de nueve toneladas de carbono; en el mundo biologico, solo los arboles de gran tamaño pueden almacenar mas que esto.
Las poblaciones de ballenas, en algunos aspectos, son mas eficientes en almacenar carbono que los bosques. Una vez que un bosque ha terminado de crecer o regenerarse y alcanzar un estado de equilibrio, no tiende a almacenar carbono adicional; cada arbol que muere y libera su carbono a la atmosfera es sustituido por otro. Pero los cuerpos de las ballenas que mueren naturalmente, tienden a hundirse al fondo del oceano. Si la ballenas muere en una zona profunda de los oceanos, el dioxido de carbono de su cuerpo podria permanecer encerrado durante un par de cientos de años.
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